Tomas Anderson (Kijanu Rivs) je programer koji noću vodi tajni život kao haker Neo. On želi da sazna odgovor na pitanje Šta je to Matriks? Morfeus (Lorens Fišburn) je najtraženiji svetski haker koji stupa u kontakt sa Neom i upoznaje ga sa pravom prirodom sveta u kome se nalazi. Godina nije 1999., kao što Neo misli, već 2199. i ljudi se bore protiv mašina nastalih na početku 21. veka. Planeta je prekrivena crnim oblacima koje je stvorio čovek kako bi sprečio mašine da koriste solarnu energiju, a kao odgovor na to mašine su do energije dolazile koristeći ljudska tela kao baterije. Svet koji Neo poznaje od rođenja je samo simulacija napravljena kako bi mašine lakše kontrolisale ljude dok ih drže na aparatima preko kojih dolaze do potrebne energije. Morfeus je ubeđen da je Neo Odabrani, za kojim je tragao celoga života. Čovek koji po legendi ima neograničenu kontrolu nad Matriksom i koji će odvesti ljude u pobedu nad mašinama.